装置導入の講習会＠X線結晶構造解析、京大宇治キャンパス#542

京大宇治キャンパスの農学研究科に、共通機器としてX線結晶解析用の装置が導入されました。今回は講習会に参加しました。私は素人なので、イメージをつかむことを意識してきいてました笑。リゾチームでしたら1時間程度もあれば充分に結晶がとれるとのこと。スクリーニング用はもちろん、ものによってはスプリングエイト等にいかなくても、論文等に使えるレベルの結晶を得られる可能性あり。1時間2,000円程度の使用料になることが想定されます。装置維持のために積極的に使って欲しいとのこと。サイドワークで結晶しこもうかな笑。機密情報とかじゃないので覚書のメモをアップ。

X線によるタンパク質の結晶構造解析の説明パネル

ドアの開閉とランプ

銀の部分を推して広げる

横にスライドする

もしくはしたのタブを動かすと

観音開き

 X線発生源等

装置の内側

 中はこうなっている。50,000Vの電源があるので、浸水等したらヤバイ。

 たちあげるソフトは3種類

左から順に立ち上げ。

 装置とのやりとりをしている。主にバックグラウンドで。

中央。

 まず4軸(2theta, phi,..., copper)

センタリング、結晶を中央に。×印ではなく、回転しても動かない位置へ。目盛は0.1mm

先に結晶を1つつける

セットする。紙を挟むとやりやすいとのこと。

90℃回転したらずれる

 棒みたいなやつを入れて回して位置を調製

 180℃回転

繰り返して軸が一致するか確認

 回転例

回転例

格子定数の決定

逆位相空間にて。ノイズの除去等も可。

より適切なほうを選ぶ、通常上2つ

ストラテジー、適切な測定方法を選択

読み込んで、さらに結晶の写真も撮っておく

 測定時に低温領域の滞在時間を短くしておかないと、凍るので注意

 ファストスキャンと本測定をやって、それから結晶の写真を得る

 ここらへんは経験不足でわからなかった笑

近くの休憩スペース

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