京科学者のキレイになる実験ほか_ブログ内神庭研究室

科学者のノウハウが研究以外でも役に立つことを紹介する、なんでもありの趣味ブログです。知識がない人にも科学の言葉を届けるきっかけになれればと思います。当初は美容系に切り込んでやろうと思っていましたが、仕事じゃないので手軽さを重視した結果、現在はグルメブログが中心になりました笑間違えることはあるかもしれないけど、科学者として、嘘のない、正しい情報を発信するつもりです。 ※法令は遵守します（笑）

2020年9月18日金曜日

タンパク質分子ビュワーで遊ぶくだり＠荷電アミノ酸残基を眺めてみるなど_#683

タンパク質ビュワーで遊ぶくだり。ある複合体タンパク質中の、特定のタンパク質のアミノ酸残基を青、シアン、赤、オレンジで表示。それ以外のタンパク質についても↑のアミノ酸を色変えないで表示。相互作用についていろいろ考えながら実験をデザインするなど。 (出しても私とグループの研究結果に問題のない、一般的な内容を出しています)。

タンパク質はリボン図、荷電性のアミノ酸の側鎖を表示して、相互作用を眺めてます笑。タンパク質分子内、複数のタンパク質分子間で塩橋つくってたりとかで、いろいろ考える余地があるんですわ。だから、あえて、注目しているタンパク質以外の側鎖も表示してます。